一颗来历不明的小行星以完美的角度和速度切入地球轨道，在现今墨西哥的尤卡坦半岛处发生撞击。碰撞能量和后来遮天蔽日的沙尘导致地球上80%物种灭绝，而小行星包裹着的一尊神秘人造物（后世将其称为“神印”）则被海水覆盖，静静地躺在墨西哥湾的海底。
虽然大部分生命体遭到灭绝，但是地球上的生命进程并没有停止，反而为人类这种智慧生物的出现拓展了空间，所以有些理论认为神印事实上能够加速当地智慧生命体的生成。换句话说，人类的诞生可能与这种古老的外星装置不无关系。
200万年前
一群科技更为先进的外星生物发现了位于银河系旋臂星云的“海洋星球”塔·弗兰提斯（Tau Volantis），这批外星流浪者原本的星球已经接近死亡，塔·弗兰提斯正好为它们提供了宝贵的栖身之地。
之后的某个时间点，外星人在塔·弗兰提斯的海底发现了一尊双螺旋形状的神秘装置，由于它不断地在向周围广播高强度的电磁信号，它们将其视作重要的可持续能源，不久之后便仿制出了大量类似的装置分布于整个星球表面。
很快一场灾难在塔·弗兰提斯上爆发，绝大多数外星人都被它们自己崇拜的神印转换成“尸变体”（Necromorph）并且开始屠戮它们的同胞，等到这场屠*提供了足够数量的生物质以后，神印诱发了一场“聚合事件”，所有感染者和死去的尸块都被某种力量吸引到了一起，巨大的压力将这些血肉聚合起来，在星球的轨道上形成了一个有机体组成的“卫星”（Brethren Moon “血月”）。
尽管种族已经濒临灭绝，为了阻止神印祸害其他的智慧种族，剩余的外星人建造起一台巨大的环境改造机械，将整个塔·弗兰提斯星球表面用急速冷冻起来，所有的神印就此被埋藏于厚重的冰层之下，“血月”的融合过程被暂时中止。
“血月”是有知觉的生命体，可以看作“尸变体”（necromorph）的终极形态，目前人类还不清楚“血月”存在的目的是什么，不过有许多证据显示它们成形之后依然会继续寻找并吞噬其他有机生命。
公元2045年-2291年 小说《死亡空间：殉道者》
随着“新地平线拓殖基地”（The New Horizons Lunar Colony ）在月球上建立，人类正式进入了外空殖民时代，但是地球和殖民地之间的矛盾却很快陷入了不可调和的状态，经过一系列尖锐冲突，人类总算暂时实现了大同，由新成立的地球联邦政府统一协调和管理地球以及太空殖民地的事务。
公元2214年
迈克尔·奥特曼博士（Dr.Michael Altman）和他的团队在墨西哥的希克苏鲁伯陨石坑地底发现了一尊明显带有古代文明遗迹的雕像，这是人类首次接触这种带有双螺旋结构的神秘装置。此后长达一年的详细研究中，团队始终无法确认这种装置的详细构成，唯一能够检测出来的元素是铋，一种半衰期极长的稀有金属元素，后来这个装置被奥特曼博士命名为“神印”（The Marker）。
在研究期间，曾经出现过一次研究人员的大规模死亡事件，导致第一次“尸变体狂潮”在地球上的爆发。不过奥特曼博士通过精神链接与神印进行沟通，双方似乎达成了某种默契，之后的“尸变体狂潮”被联邦政府军迅速镇压。此后政府对外界封锁了一切关于神印的消息，奥特曼博士的研究得以继续。
公元2215年
地球联邦政府认为神印不断发出的高强度电磁信号可以为人类解决能源危机提供理论基础，但是这遭到奥特曼博士的强烈反对，为此他不惜向公众披露了关于神印的真相，希望藉此阻止政府的危险举动。
几个星期之后，奥特曼博士遭到联邦政府特工的暗*（实际上这些特工被神印的力量所迷惑），这在民间掀起了轩然大波，越来越多的人选择加入一个神秘的宗教组织，“统一教”（Unitology），这些人将迈克尔·奥特曼博士视作为了人类的大同理想而牺牲的“殉道者”。
公元2311年 小说《死亡空间：催化剂》
联邦政府对地球的统治已经岌岌可危，但是他们对神印的研究始终没有停止（政府一方面希望通过神印解决能源危机，另一方面也希望能利用神印的能力研究武器）。尽管期间还经历了多次“统一教”的破坏行动，联邦科学家们依旧在一处秘密基地完成了对神印的逆向工程研究，成功制造出几个复制体。
由于神印的具体构成依旧不明，所以科学家只能用铋来代替其他的未知元素，所以复制体看上去呈通体红色，被称为“红色神印”，为了复制体与本体之间的区别，人们将最初的那尊称作“原始神印”。而且为了研究的保密性和安全性，这些“红色神印”被分别部署在远离地球的殖民地，比如人马座比邻星、“格利泽581”和“圣盾VII”这样的荒凉星球。
公元2312年
位于天鹅座星系“圣盾VII”上的“红色神印”（Marker 3A）第一次被激活测试，研究人员根据其DNA指令创造出了历史上第一组重构微生物。不过情况立刻急转直下，研究人员先是发现“红色神印”依然人有着类似的催眠和诱导效果，紧接着“尸变体”便出现导致整个研究团队死亡。
这场意外让科学家发现神印不但能够创造“尸变体”，还对它们有着绝对的控制能力，几乎所有的“尸变体”只要接近“红色神印”一定范围就会进入休眠状态，后来的研究者将这片区域称为“死亡空间”。军方对“圣盾VII”的项目评估为失败，所有关于“圣盾VII”研究基地的信息被全部封存，那颗“红色神印”也被遗弃在星球表面，而基地内死亡的人类形成的大量“尸变体”在后来组合成了一个巨大的有机结构，被称为“主脑”。（类似“血月”，但还没有达到“血月”的规模）
“圣盾VII事件”还导致了另一个意外结果，意外发生时军方监测到三颗“红色神印”几乎同时收到了来自“原始神印”的信号，科学家通过信号之间形成的托勒密阵列追踪到了信号的来源：一颗位于银河系旋臂星云的“冰冻星球”，塔·弗兰提斯。联邦政府立即派遣了一支殖民舰队前往塔调查（该舰队就成了日后的主权殖民地联盟）。
公元2314年
研究人员在塔·弗兰提斯发现了古老的外星文明和大量“红色神印”，这让人类在理解神印的起源有了重大突破（此时人类错误地以为“神印”是由塔·弗兰提斯的那些外星生物所铸）。不过负责运送原始神印的研究人员开始出现幻觉，一位安全部队士兵将外星人用来冰封星球的装置关闭，导致整个殖民地开始出现“尸变体狂潮”。
主权殖民地委员会评估了当前的的研究资料和证据，他们得出结论：塔·弗兰提斯已经成了“五级第一次接触场景”（相当于种族灭绝级别的威胁），“五号预案”自动生效。
“五号预案”是最高级别的响应预案，该预案将所有殖民地上的研究人员视作反叛者，需要立刻处死，研究资料、监控数据和通讯备份都需要被确保完全销毁。而且执行该预案的武装人员也必须在任务完成后自*，以确保没有任何资料有机会外泄。
至此，主权殖民地联盟在塔·弗兰提斯的首次拓殖任务宣告失败，地球以及其他殖民地的人们再没有听到任何关于这次行动的消息。
公元2446年
“和谐开采公司”（CEC）旗下的行星裂解飞船“石村号”（USG Ishimura）首航。
行星裂解（Planet crack）是人类为了解决资源限制而开发出的最新“采矿”技术，原理就是用重力牵引将一整块星体碎片拖拽至星球轨道，然后在轨道上直接进行有用矿物质的分拣工作，这种采矿效率极高也极具破坏性，往往一艘大型行星裂解飞船在几个月的时间里就可以将一颗星球“掏空”。
公元2505年 动画电影《死亡空间：坍塌》
“和谐开采公司”非法进入圣盾星团进行勘探工作，“圣盾VII”被评估为拥有极其宝贵的矿藏资源，于是公司开始悄悄在那里建设殖民地，为日后的行星裂解作准备。
公元2508年 “石村号事件”
“和谐开采公司”高层中的统一教徒发现“圣盾VII”上很可能藏有一尊“红色神印”，预计可能是过去地球联邦时期所铸，于是“石村号”被派往那里进行非法的开采活动。就在“石村号”赶往“圣盾VII”的路途中，许多星球上的殖民地工程人员已经出现了失眠，痴呆的病例，并且暴力事件也时有发生，到“石村号”抵达前不久，已经有超过50人自*。
“石村号”泊入“圣盾VII”轨道之后，立即依照公司指示将“红色神印”从地面转移至飞船仓库。飞船人员随之开始出现不同程度的精神问题，不过舰长本杰明·马修斯依然启动了“圣盾VII”的裂解工作，过程中产生的强干扰导致飞船与地面殖民地之间的通讯暂时中断，而此时200年前潜入地下休眠的主脑也适时醒来，指挥“尸变体”袭击其他工程人员。
一架紧急航天器载着幸存的工程人员逃往轨道上的“石村号”，但是也将“尸变体”带上了飞船甲板，于是将这艘飞船也变成了人间炼狱，大部分船员死亡，只有少数活了下来。
公元2508年末 《死亡空间》及《死亡空间：血统》
收到“石村号”发出的求救信号之后，CEC派遣小型搜救飞船凯利昂号（USG Kellion）赶往事发地点，由于担心在“石村号”上工作的女友，系统工程师艾萨克·克拉克（Isaac Clarke）也随该舰一起出发。
在“石村号”内部的探索中，艾萨克逐渐发现了事件背后的真相，这些都是CEC不择手段获取“红色神印”所付出的“合理损耗”。最后艾萨克将“红色神印”重新送回它出土的地方，并找到机会*死了主脑，作为凯利昂号唯一的幸存者乘坐救生艇逃离了“石村号”。
公元2509年
从“石村号”逃离大约三周之后，艾萨克乘坐的救生艇被搜救队找到，经过短暂的休整，他被送往位于土星轨道的泰坦空间站（Titans Space station）。“和谐开采公司”以创伤后应激障碍为借口，一直将艾萨克关押在太空站的精神病房里，但实际上他们在试图提取“红色神印”在艾萨克脑中留下的信息，以此为蓝图制造“12号神印”（Site 12 Marker ）。
艾萨克是少数接触过神印但没有被感染的人类，科学家认为只有极高精神力的人才能够与神印产生共振。
公元2509年 《死亡空间：余波》
凯利昂号的营救行动失败之后，CEC又派遣一艘更大的医疗搜救船“奥班农号”（USG O'Bannon）前往调查，不过这次“奥班农号”也同样失联。
三周之后，军方的武装拦截船“阿布拉西斯号”（USM Abraxis）带着殖民地联盟的审问官以及几名陆战队员登上“奥班农号”，他们在那里找到四名幸存者，再经过一番残酷的审讯程序之后，政府大致了解了事件的真相，并且将这些灾难性事件归咎于恐怖分子袭击予以掩盖。
公元2511年 《死亡空间2》
地球政府成功在泰坦空间站建造了新一代的神印复制体（Site 12 Marker ），不久之后统一教便袭击了泰坦空间站，致使大量实验中的“尸变体”被释放到居住区，“泰坦事件”爆发。
艾萨克被统一教徒戴安娜（Diana）救出，为了阻止“尸变体”进一步*害平民，艾萨克进入实验区摧毁了12号神印，但是泰坦空间站也因为核动力发生器失衡，随即发生爆炸，除侥幸逃出的艾萨克与采矿工程师艾莉·兰福德之外，空间站上的人员全部死亡。
公元2511年-2514年
艾萨克同艾莉·兰福德一起逃出泰坦空间站之后，为了躲避联邦政府和统一教的搜捕，一起隐居在“新地平线月球基地”，期间两人还一度发展成恋人。不过同艾莉醉心于调查整件事情的真相不同，艾萨克看待自己的遭遇比较消极，始终拒绝面对过去，为此两人最终分道扬镳。
公元2514年 图文小说《死亡空间：解放》
“泰坦事件”结束后，地球政府在尤瑟尔星（Uxor）使用类似的技术建造了另一尊“红色神印”，不过为了保护星球上的殖民者，他们使用了某种屏蔽技术将“神印”封装在保护罩下，能够有效地阻隔神印的电磁信号。
男主角约翰·卡弗的妻子达玛拉·卡弗就是尤瑟尔星“神印”屏蔽站的工作人员，她在研究中意外得到了两百年前主权殖民地时期关于“神印”的研究资料，上面记录了“红色神印”所收到的来自“原始神印”的信号，以及如何利用托勒密站进行三角测量定位信号源的方法。
这个发现引发了统一教对尤瑟尔星的恐怖袭击，在“尸变体狂潮”中，达玛拉·卡弗和她的儿子双双被*，而约翰·卡弗为了完成妻子的遗愿决定与艾莉·兰福德合作，帮助他们找到达玛拉生前所作的研究资料。他们终于在托勒密站被摧毁之前成功定位了信号源，就是塔·弗兰提斯。
迫不及待想要寻找真相的艾莉立刻组建了一支队伍前往，不过没有达玛拉，他们依旧没有能力翻译数据库中“神印”的特殊语言，艾莉临走前让约翰·卡弗去月球基地寻找“一个曾经与神印高度链接却依旧保持理智的人”，即艾萨克·克拉克。
公元2515年 《死亡空间3》
约翰·卡弗一行人来到月球基地寻找艾萨克，但是他们的行踪一直都被统一教所掌握，这些狂热分子在月球基地又一次制造混乱打算抓捕艾萨克，但是被他侥幸逃脱。艾萨克跟随卡弗一行人追踪艾莉的S.O.S信号来到了塔·弗兰提斯，不但成功找到了失踪的艾莉，同时还发现了200年前的“神印”研究中心。
在那里，他们发现原来塔·弗兰提斯并非“神印”的诞生地，而基地中的外星生物也只不过是和人类一样有着相似命运的受害者，而那些“红色神印”所接受到的信号也只不过是“血月”用来引诱其他智能生物来到这里的诱饵，事情等于又一次回到了起点。
此时尾随而至的统一教徒成功关闭了当年外星人制造的星球冷却装置，巨大的“血月”被重新唤醒，虽然还不是完全体，但是依旧有着控制所有“尸变体”的能力。而且“血月”一旦聚合完成，它就可以追踪其他“神印”所在的位置，吞噬那里的有机生命制造出更多“血月”。
最后艾萨克与卡弗联手，成功将初生的“血月”*死，两人九死一生活了下来，还成功地抢夺了一艘统一教的飞船打算回到地球警告人类。不过当两人终于回到地球轨道，却发现已经有许多“血月”早他们一步到达了那里，其中一颗升起来到他们停泊的轨道，似乎正要吞噬他们所乘的飞船......
全文完
