妙蛙种子是小智做梦都想收服的一只神奇宝贝，当初刚没有皮卡丘之前，他想要的一只神奇宝贝就是妙蛙种子，在小智和小霞等人一起旅游的时候，在森林里就遇见了一只妙蛙种子。最初的时候小智遇见的是走路草。
走路草白天把身体埋在土里，并用自己的全身吸收土地中的营养。土地越是肥沃，它的叶子就会变得越有光泽。沐浴月光就会开始活动，在夜晚里四处散播种子而到处走动。属于草系也属于水系，当小智想收服它的时候被小霞阻拦，因为小霞也喜欢它
在小霞想用神奇宝贝收服走路草的时候被突然出现的妙蛙种子阻止，妙蛙种子是小智一心想要的神奇宝贝。所以小智想要收服它，但是妙蛙种子非常的讨厌小智他们，因为这个妙蛙种子负责保护这里的神奇宝贝，而小智想要收服他们
妙蛙种子逃离之后，小智一行人不停的踩中陷阱，这些陷阱都是为了保护这里的神奇宝贝而设置。当小智他们再次遇见妙蛙种子以及护理它们的训练家的时候，才知道事情的真相，这里的神奇宝贝几乎都是被训练家抛弃的神奇宝贝，而妙蛙种子实力强大所以在这里充当保护者
再次相见的时候妙蛙种子还是很排斥小智，就在这个时候火箭队出现，火箭队出现在这里是为了夺取这里的神奇宝贝，在他们用机器吸取这里的神奇宝贝的时候，小智帮助妙蛙种子一起拯救这里的神奇宝贝，妙蛙种子因此被小智感动。
在赶走火箭队之后妙蛙种子自愿跟随小智，但是前提必须打赢它。小智用皮卡丘打赢了妙蛙种子，才算正式拥有了这只神奇宝贝。可以说没有火箭队的捣乱，小智就没有办法得到这只神奇宝贝。
