《大侦探皮卡丘》2/3：当宠物小精灵出现在现实世界。
一条狗影视。
皮卡丘把家里翻了个底朝天，终于找到了那个让小精灵发狂的神秘物品，名叫R。为了获取更多信息，小次郎决定去找电视台的武藏子。在那他碰巧遇到了坂木和小银这对父子，这俩人的关系看上去也不咋地，录完节目就开始吵嘴。最后坂木还被他的搭档百变怪给推了出去。记住这个百变怪，还有他那双斗斗眼，小次郎成功从武藏子那儿套取了情报。
接着他们又去了一家地下擂台赛，那有个只穿着风衣露出上半身的猛男，他还有一条喷火龙。上次皮卡丘的10万伏特差点把他电成烤肉串，这次他要报仇雪恨，非要皮卡丘再跟喷火龙大战300回合不可。可惜失忆的皮卡丘连技能怎么用都忘了，小次郎教给他的招式也忘得一干二净，更别提喷火龙还闻了R。
火力全开，皮卡丘被打的满场飞，小次郎实在看不下去了，只能亲自上阵。这主人都亲自上阵了，那风衣男还能坐视不管吗？也跟着上了。结果风衣里藏着的2全都被释放了出来。在场的小精灵闻到后全都疯了，开始疯狂地攻击周围的人，幸好靠着暴鲤龙的帮助才打败喷火龙，皮卡丘和小次郎才勉强逃脱。
然后他们就被警察叔叔请去喝茶了，爸爸的朋友给小次郎播放了车祸现场的录像带，只见那辆车直接翻了个底朝天，这样的车祸根本没人能活下来，皮卡丘和小次郎瞬间心如死灰。
但是事情突然出现了转机，一个把头发染成粉红色的小姐姐带着小次郎去找坂木，坂木告诉他你爸绝对没死。于是坂木就给小次郎展示了那天事故发生时的全息投影，只见父亲竟然从车里爬了出来，被一个小精灵给救走了。皮卡丘竟然被这只神秘的小精灵消除掉了记忆。
这事还得从坂木那说起，这只小精灵可不简单，他叫超梦，是这个世界的头号大佬，没人能比他牛逼。坂木一度因为忙于事业疏忽了，自家的孩子小银。这小子受够了老爸忽略他的感觉，决定让老爸知道他的厉害。于是他建了一座实验基地，他带着皮卡丘武藏子和可达鸭一同前往那座神秘的实验基地。一路上惊险刺激，简直比坐过山车还要刺激。
他不仅发现了许多惨无人道的实验室，还通过全息投影目睹了超梦逃脱的全过程。等他们看完出来后，却发现武藏子和可达鸭已经被吊在了屋顶上，真是吓破了胆。他们费尽千辛万苦才把人给救了下来，没想到却遭到了一大堆小精灵和人的疯狂追*，简直是命悬一线。
最后还是可达鸭这家伙头疼起来，用了像炸弹一样的念力才把他们给救了出来，真是惊心动魄。然而冒险并未就此结束，他们4个刚逃离虎口又陷入了新的困境。他们所在的这片山头开始剧烈晃动，简直就像是地震一般。于是他们4个不得不开始了一场前所未有的铁人三项比赛，跑步游泳，可惜就是没有自行车。
不过这里倒是有个障碍跑环节，原来这片山头并不是真正的山，而是一只巨大化的土台龟。等到土台龟不再活动时，皮卡丘却因为在水中呆的太久变得虚弱不堪。小次郎急得像热锅上的蚂蚁，赶紧向妙蛙种子求助，希望他能救救皮卡丘。虽然语言不通，但妙蛙种子似乎明白了小次郎的意思，立刻召集了一群小伙伴，带着小次郎和虚弱的皮卡丘来到了一个神秘的圆盘上。
