F-35的座舱很有未来感，触控式操作面板、多功能头盔式显示器、语音识别技术，都是尖端科技的结晶。然而，这些花活儿虽然在理论上听起来都很不错，但是不少飞行员却感到相当不适应，甚至抱怨令人失望。
据美国“大众机械”网站报道，一位匿名的F-35飞行员表示，“座舱确实相当华丽，充满了各种信息的显示屏，只需轻按几下即可显示其他重要情资，还可以自己设定显示模式，以面对特定任务。”比如你可以按面板的飞机缩图，就能出现飞机目前的各种情况；你再按作战信息，就会显示目前战场上的敌人位置。
然而，触摸屏缺乏实际按钮的那种触觉反馈。按钮具有令人愉悦的咔嗒声，可以立即使操作者知道已完成工作，但触摸屏却没有这种效果，而且还会失灵。几乎每个玩智能手机、平板电脑的人，都曾遇过明明已经点了触摸屏上的虚拟按钮，却没有任何反应，可能要点上好几次才会有动作。这种情况在F-35上也会发生，而且有20％的概率会出现触控无效的情况。
更大的问题是，当战机在高g机动飞行时，触控操作就会变得更容易失败。“我在飞行中大约20％的概率会点到错误的地方，又需要花时间重新操作。各位想想，你们在传统手机上用大拇指打字的速度，与用食指在大型平板上的打字，哪一种快?”
其他问题还包括价值40万美元的多功能显示头盔。该头盔会投射各种信息，取代了以往的平显（HUD）与光学/红外显示器。理论上，这种头盔应该表现更好，但是不少F-35飞行员认为他们仍然比较习惯老式的HUD，具有更好的显示信息的能力，而无需“缩小”信息画面以适应头盔的视野。
实际上，在F-35刚服役的初期，飞行员们就对头盔显示器有不少抱怨，包括显示信息太亮，使飞行员在夜航时难以看清楚外界环境；头盔偏重，可能会伤害飞行员颈椎等。
另外，先进的语音声控识别功能几乎没有人用过。飞行员表示，“我在受训时的确学习了F-35的语音声控，但我在实际飞行中根本就没去用它。它可能在地面模拟课程中可以很好地工作，但它在实际飞行的g值环境下并不可靠，我没有遇到哪个飞行员真的通过声控操作战机。”
的确，当战机在高g机动时，飞行员光是呼吸都必须很专心，真的没有多余的精力说话下指令，而飞行员在战机里的主要对话，多半是与僚机、指挥基地通信，不太有机会和战机说话。
因此，F-35座舱采用的技术和操作模式一个个的十分先进，但不见得每个都好用，说不定第6代战机的座舱又稍微恢复传统。
