在运输过程中，苗木暴露于阳光之下，长时间被风吹袭，会造成苗木失水过多，质量下降，甚至死亡。所以，在运输中尽量减少水分的流失和蒸发，对保证苗木的成活率有很大作用，这就是要求我们必须注意苗木的包装与运输。
为什么要包装
据相关介绍：曾用油松和侧柏一年生播种苗进行晒根试验。试验结果表明，在华北3月下旬的阳光照射下，油松一年生播种苗晾晒60分钟全死；侧柏一年生播种苗晾晒4小时的成活率只有0.31%。而且经过日晒的苗木成活后再生长也会受到影响，侧柏苗对照的平均苗高为39.9厘米，晒1小时的平均苗高为31.3厘米，晒2小时的为26.8厘米，晒4小时的生长不正常。而以包装袋形式包装的云杉苗，经过1周其成活率仍为100%。由此可见，苗木运输时间较长时，要进行细致的包装，一般用的包装材料有：草包、蒲包、聚乙烯袋、涂沥青不透水的麻袋和纸袋，集运箱等。
包装方法
可用包装机或手工包装。对于大苗如落叶阔叶树种，大部分起裸根苗。包装时先将湿润物放在包装材料上，然后将苗木根对根放在上面，并在根间加些湿润物；或者将苗木的根部蘸满泥浆。这样放苗到适宜的重量，将苗木卷成捆，用绳子捆住。小裸苗也用同样的办法即可。而针叶和大部分常绿阔叶树种因有大量枝叶，蒸腾量较大，而且起苗时损伤了较多的根系，起苗后和定植初期，苗木容易失去体内的水分平衡，以致死亡。因此这类树木的大苗起苗时要求带上土球，为了防止土球碎散造成根系水份损失，所以挖出土球后要立即用塑料膜、蒲包、草包和草绳等进行包装；对特殊需要的珍贵树种的包装有时用木箱。包装时一定要注意在外面附上标签，在标签上注明树种的苗龄，苗木数量，等级，苗圃名称等。
裸根苗的装车方法及要求
装车不宜过高过重，压得不宜太紧，以免压伤树枝和树根；树梢不准拖地，必要时用绳子围拴吊拢起来，绳子与树身接触部分，要用蒲包垫好，以防伤损干皮。卡车后箱板上应铺垫草袋、蒲包等物，以免擦伤树皮，碰坏树根；装裸根乔木时，应树根朝前，树梢向后，顺序排码。长途运苗最好用苫布将树根盖严捆好，这样可以减少树根失水。
带土球苗装车方法与要求
两米以下（树高）的苗木，可以直立装车，两米以上的树苗，则应斜放，或完全放倒土球朝前，树梢向后，并立支架将树冠支稳，以免行车时树冠晃摇，造成散坨。土球规格较大，直径超过60厘米的苗木只能码1层；小土球则可码放2至3层，土球之间要码紧，还须用木块、砖头支垫，以防止土球晃动。土球上不准站人或压放重物，以防压伤土球。
运输时应注意的问题
如果是短距离运输，苗木可散在筐篓中，在筐底放上一层湿润物，筐装满最后在苗木上面再盖上一层湿润物即可，以防苗根失水。如果长距离运输，则裸根苗苗根一定要蘸泥浆，带土球的苗要在枝叶上喷水，再用湿苫布将苗木盖上。无论是长距离还是短距离运输，要经常检查包内的湿度和温度，以免湿度和温度不符合植物运输。如包内温度高，要将包打开，适当通风，并要换湿润物以免发热，若发现湿度不够，要适当加水。另外，运苗时应选用速度快的运输工具，以便缩短运输时间；当然，如果条件允许的话的还可用特制的冷藏车来运输。
