二者的生长周期、产量以及生存方式不同。从生存方式上来说，转基因是生物技术的结果，而非转基因则是通过大自然进行自然选择的。
从产量上来说，非转基因的产品也要比转基因的产品产量低。
从生长周期上来看，转基因的生长周期是变化的，而非转基因的则不变。
转基因是指利用分子生物学技术，将某类生物的基因输入到其它生物体内，改变对方的基因遗传物质，使这类生物的遗传物质发生改变，通常这种改变都是迎合人类对于消费、健康和食用方面的需求。
而非转基因的植物生长周期是根据自然规律的，必须在一定的时间内才能成熟。而转基因的植物，没有按照四季规律地生长，它们缩短了作物开发的时间，打破物种界限，加快成熟。
