底滤的鱼缸中，鱼的糞便是通过排污囗排出主缸的。
底滤的鱼缸是大型鱼缸的主流过滤方式，利用重力原理把主缸中的水和排泄物导流进入过滤仓，通过过滤棉生化棉陶瓷环细菌屋火山石的综合过滤，实现水质的净化，再用水泵抽回到主缸。
底滤鱼缸的粪便可以通过换水的时候排出，也可以让其在缸内分解，只要硝化系统建立好，不会对鱼儿产生危害。想要建立硝化系统，需要定期往缸内添加细菌液或其它原料，同时还要注意关灯爆氧，一段时间后硝化细菌就会大量繁殖了。另外，不要轻易给鱼缸*菌消毒，不然也会对其造成破坏。
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