一切事物都是为了毁灭而被设计，我们被困在重复生与死的螺旋中，这是诅咒，还是惩罚？我们是否总有一天会起身反抗交给我们无解迷题的神?
接着2B的内心独白:机械生命体和我们人造人的差异到底在哪里?演变到最后产生意志和感情的机械。他们临死前最后一声呐喊，现在还在我的心中回荡。至此尼尔机械纪元的第一部分故事就结束了， 对应的正是游戏的第一个真结局。实际上在9S消失的期间他发现了惊人的事实一-人类早就已经全数灭亡了 。尤尔哈计划是个巨大的谎言。而2B也一直被某种宿命纠缠着，作为曾经尤尔哈逃兵的A2又知道些什么呢?
尤尔哈计划·司令官：回想起！故乡倍夺走的痛苦！我们不能放弃。把大海、天空、大地……把强势的机械生命体夺走的地球夺回来！抱着本次作战一定要成功的决心，此时此地，就要让这场战争结束！人类永远光荣！
司令官解释:没有人能毫无意义地投入战斗，我们需要值得奉献生命的神。
在辅助机的帮助下，9S和2B以及A2都借由保存的资料，复活了。辅助机说到：一切事物都是为了被毁灭而设计，他们被困在重复生与死的螺旋中，但是，在轮回中挣扎，就是活着的意义。
