《天地劫：神魔至尊传》的游戏背景被巧妙地设定在中国古代的某个年代。这是一个妖魔精怪仍在深山野岭出没伤人，御剑、魔道与咒法活跃的时代。自先祖黄帝大败蚩尤，确立天地人三界之限后，已经过去了一千多年。在这漫长的岁月里，世人受此福祉，得以安居乐业于人间之上。然而，妖魔之祸并未从此平息。
为了对付这些仿佛来自异界的访客，少数有识之士潜心修炼气御剑之法，或是精研阴阳玄法咒术。他们与这些不速之客时起争战，然而知晓这些事的人并不多。世人仅知道这些剑术门派的存在，知道他们偶尔会为降妖除魔的善举，却不知道这些妖魔为何而来，也不知道过去曾发生在黑暗中的一切。
在当今之世，御剑以中原三派：“崆峒”、“紫云”、“天玄”三派为尊，阴阳咒术以“四象门”居首。位居泰山的天玄门经常主动清剿盘据山中的妖魔，很得当地居民的好感。这日，天玄门得报在泰山某处又有妖魔出没害人，门主应奉任冒着风雨，领门徒一行前往调查。就在这风雨呼啸的一天，一场惊心动魄的冒险正悄然展开。
