1.银河战争篇：这是圣斗士星矢的故事开始，主要讲述了青铜圣斗士的故事，共有6话。
2.教皇刺客篇：又称白银圣斗士篇，共有39话。
3.黄道十二宫篇：这是黄金圣斗士的故事，从第40话至第73话。
4.北欧仙宫篇：讲述的是北欧神话的故事。
5.海皇神殿篇：讲述的是海皇波塞冬的故事。
6.冥王十二宫篇：这是冥王哈迪斯的故事的开始，共有13集。
7.冥王冥界篇：继续讲述冥王哈迪斯的故事，分为前章和后章。
8.冥王极乐净土篇：继续讲述冥王哈迪斯的故事，这是最后一部分。
此外，还有多部剧场版和外传，包括：剧场版：《圣斗士星矢:邪神艾莉丝》、《圣斗士星矢:众神的激战》、《圣斗士星矢:真红少年传说》、《圣斗士星矢:最终圣战的战士们》、《圣斗士星矢:圣域传说》、《圣斗士星矢:天界篇序章》、《圣斗士星矢:黄金魂》。外传：《圣斗士星矢Ω》。以上就是圣斗士星矢的主要故事线和作品顺序
