故事发生在一片原始森林，一支科考队来到这里寻找传说中的大脚怪。这片森林与别的森林不一样，它的生态环境与数亿年前的地球生态环境一样。在这片丛林中有大量远古时期才有的怪兽，而安娜的爷爷在这次考察中神秘失踪。12年后，长大后的安娜通过3d立体图像测试之后找来爷爷的弟子谢博士，还有同事李宇航与大雷组建团队，再次踏上那片神秘丛林去寻找爷爷的踪迹。
经过跋山涉水，一行人刚入森林就发现了一个巨型脚印。众人以为是金刚的脚印，就在大家仔细研究之时，有人发现身后有动静，安娜缓缓转身，一条巨型猪鳄迎面扑来。众人哪见过这生物，连忙撒丫子开溜。但两条腿终究跑不过四条腿，一转眼就有队员被猪鳄摁倒了。李宇航见状连忙抄家伙就抡。
可谁知这猪鳄皮糙肉厚，一个神龙摆尾就掀翻了李宇航，安娜连忙开枪，结果连猪鳄的皮都没打破。危急时刻，几个壮汉冲了出来提供火力支援，猪鳄才被击退。
原来这些人是谢博士请的探险队。俗话说众人拾柴火焰高，这下丛林之旅应该能轻松一点了。结果刚走没多远，猪鳄又跟来了，而且这次数量更多，原来刚才是去喊同伴了。队员们一个个都成了猪鳄的点心，众人四处逃窜。
李宇航爬上了树，下面的猪鳄虎视眈眈，树上突然出现一条毒蛇咬向他，直接吓得掉了下去。正当他以为自己这下死定了的时候，突然远处冲出一道黑影，抓起底下猪鳄的尾巴甩了出去，救了李宇航一命。这难道就是传说中的大脚怪？只见他抡起拳头对着猪鳄就是一顿猛砸。而另一边安娜也遭遇了猪鳄的偷袭。危急关头，大脚怪仿佛开挂了一般从天而降，一脚就将猪鳄踩的奄奄一息，秉着做好事不留名的习惯，大脚怪抱头就跑。
猪鳄的危机算是解决了，但小区却闹起了矛盾，大雷惨遭*害。原因是偷听到了谢博士的秘密。原来他此番目的并非寻找大脚怪这么简单，早在十几年前，它就与境外科研机构勾结意图猎*大脚怪，收取身上的血液做成治疗人类疾病的神药，这与科考队的目的背道而驰，于是两队人马分道扬镳。
然而没多久探险队这里又遇到了新的麻烦，一只巨型蜘蛛瞬间将一名队员扎成了串串，场面一度混乱。另一边的科考队则遇到了大脚怪，但大脚怪表现的并无恶意，这让安娜陷入了困惑之中。接下来他们的命运将何去何从，安娜又能否找到自己的爷爷？
