《逃出克隆岛》第二部。
这个荒野小岛竟然是一个人类养殖场，专门为富人续命！到了晚上，林肯又做了个噩梦，梦见了大海游艇和溺水的寡姐。林肯被吓醒了，他想知道这到底是怎么回事，于是放了一只飞蛾。跟着飞蛾爬进了通风管道，竟然是一条走廊。
为了搞清楚真相，林肯换上了工作人员的衣服混进了基地。潜入各个房间后，他发现事情并不简单，原来孕妇生产后就会被*死，孩子则被送到一个和孕妇长得一模一样的女人手中。幸运的是，中奖的黑哥并没有被挖掉内脏，但他很快就要被开刀了。
就在开刀的瞬间，黑哥睁开了眼睛，清醒后挣脱了束缚想要逃跑，可惜最后还是被保安拖了回去。黑哥的哭喊也没有引起任何人的同情。虽然林肯还不知道具体是怎么回事，但他知道明天寡姐也要抽中去这里。
于是林肯冲进寡姐的房间，拉着她准备离开。可这时，博士也发现了林肯的异常。于是基地里的保安开始对林肯进行追捕。两人在逃离的路上，不小心掉进了培育克隆体的实验室中。这才明白，这里其实是一个骗局。天堂岛是假的，避难所里的人也不是真正的人类，而是被克隆出来的生命体。他们的记忆都是被人为灌输的。
突然，安保人员出现了，两人赶紧逃跑。在逃跑的路上，林肯发现了另一个通风管道，结果这个管道竟然能成功通往地面。他们来到了一个和平的世界，没有被污染。林肯被路边的摩托吸引，想追却没有追上。这时他发现路边的指示牌和眼镜哥留下的火柴盒地址一样，两人跟着指示牌的指引，真的找到了眼镜哥。
眼镜哥还有点良心，不但把两人带回了家，还告诉了他们残酷的真相。原来他们都是克隆人，一些人需要新皮肤来整容或者生病了需要新的器官，他们就从他们身上拿。然而这些人并不知道，克隆体也有生命体征。听到这里，林肯和寡姐决定去找出自克隆自己的本体。
眼镜哥见劝阻无效，只能给他们准备好衣服，然后再帮他们买火车票。在车站，林肯通过尿液排出了身体里的体检机器人。然后眼镜哥一边催促他们上车，一边告诫他们不要轻易相信人类，因为人类可以为了自己的利益不顾一切。眼镜哥刚说完这些，下一秒就被博士派来的*手一枪毙命。
林肯和寡姐好不容易逃上了火车，来到了大都市。他们看到了寡姐的本体斯嘉丽，原来她是一个大明星。斯嘉丽因为重病正在医院里进行器官移植手术，因此被克隆出来。
另一边，警察因为眼镜哥的死追查到了林肯和寡姐身上。两人被捕后，*手追了上来。为了防止克隆人的真相曝光，他们驾驶卡车撞翻了警车，引发了一场枪战。在这场混乱中，林肯和寡姐成功逃脱，并找到了林肯本体的住所。通过人脸识别，林肯成功进入屋内。看到林肯后，本体傻了眼，因为他发现有一个和他长得一模一样的人。不是说克隆体没有生命体征吗？两人交谈中，林肯得知本体是个富二代，因为日日花天酒地，导致他这么年轻就得了肝硬化。林肯被电视中的新闻吸引住了，他希望本体能帮助他们曝光这场毫无人性的克隆交易，拯救基地里的克隆人。但本体心里有了一些小九九，他不想让克隆交易曝光。林肯建议让寡姐留在家里等待，毕竟人多目标也大。在路上，本体撕开了虚伪的面具，拿出手枪对准了林肯的头。就在两人扭打在一起时，博士派来的*手大黑赶了过来，但两个一模一样的人分不清到底哪个是克隆体。就在这个关键时刻，林肯悄悄地将手环扣在了本体的手上。于是，本体被当做克隆体*死，林肯成为了真正的人类。
