ISMRM社区最全MRI序列仿真,重建,后处理仿真学习工具包

ISMRM社区最全MRI序列仿真,重建,后处理仿真学习工具包

首页角色扮演第一序列重建更新时间:2024-07-29

ISMRM社区成员针对不同的应用,比如序列设计,序列重建,图像处理,仿真等场景,开发了很多有用的工具包,这里汇总了一下总共有24个工具包,有哪些您认识呢?又有哪些您使用过呢?或者有哪些您之前不知道,现在知道了或许有用的呢?

建议收藏,说不动哪天就会用到。

理解磁共振原理好帮手,磁共振序列仿真相关的工具:

1. JEMRIS 主要由Tony,Daniel,Kaveh等人开发,是一个开源,跨平台MRI仿真框架。

2. MRiLab 是基于Matlab的仿真工具包,非常适用于练手理解MRI物理原理,现象的工具包,强烈推荐。

3. Low Filed Simulator 基于高场采集的数据,预测低场的一些现象,典型比如水脂分离等。

序列重建相关的工具包最多,有15个:

1. BART 主要提供并行成像,压缩感知等算法实现库,而且也是跨平台支持。

2. Gadgetron 相信这个大家都比较熟悉,使用比较多提供了很多医学图像处理的算法库。

3. NYU MRF Recon 基于Matlab开发的针对MRF定量成像重建工具包。

4. RetroMoCoBox Daniel开发的回顾式运动矫正工具包。

5. NLSAM 为DTI开发的去噪算法。

6. gpuNUFFT Andreas和Florian为2D/3D数据非标准FFT GPU加速的工具包。

7. GPI 由Ashley ,Daniel和Nick一起开发的图像化编程接口。

8. ISMRMRD 通用的MRI数据格式,为了方便大家更好的共享重建,数据等目的。

9. MRtrix3 为DTI数据分析后处理而定制的高级工具。

10. DIPY 通过的多用途的科学计算工具包。

11. CORE-PI 并行成像重建相关工具包。

12. MRIReco.jL 图像重建相关的工具包。

13. SigPy Python开发语言关于迭代重建的工具包。

14. Water/Fat MR Thermometry 这个属于比较磁共振中比较少的温度测量和广泛的水脂分离技术相关工具包。

15. Yarra Framework 一个支持开发和翻译重建技术的开源框架

脉冲序列设计与执行有2个:

1. Pulseq 与平台无关的开源框架,支持脉冲序列设计与执行。

2. gammaSTAR 平台无关的磁共振序列开发工具包。

图像处理相关的有:

1. SCT 软件工具包可以用来分析脊髓多参数磁共振成像。

2. qMRLab 基于matlab开发的开源工具包,可以用来做定量磁共振成像分析和仿真。

3. QUIT 用来分析定量成像,弛豫现象的工具包

五。波谱数据处理工具包,only one

1. Gannet 主要用来做波谱数据处理和仿真的工具包。

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