首先，是《神盾局特工》前五季回顾，涉及微量剧透，尚未观看又有计划观看的观众，请谨慎收看。
第一季：复联外传
在《复仇者联盟》中不幸牺牲的寇森特工毫无预兆地复活，他如何复活也成为了剧集的第一个大坑。
复活后的寇森组建了自己的一支神盾小队，成员包括：
科学双人组菲兹和西蒙斯；
第一女打手梅姨，第一男打手沃德；
半路“捡来”的黑客斯凯；
第一季播出的时候漫威影业还没有独立，而且剧集也需要MCU电影来带热度，加上《复仇者联盟》导演乔斯·韦登还亲自执导，所以与电影的联动相当紧密。
上半部分寇森小队主要应对《钢铁侠3》里出现的绝境病毒，中间在揭开寇森的复活之谜后，下半部分转入了《美国队长2》神盾局沦陷的剧情。几位电影角色都登场亮相，《雷神》希芙和《复联》希尔特工的戏份都不少，神盾局局长尼克·弗瑞在最后一集客串出现，漫威对剧集的重视程度可想而知。
第二季：“震波女”成长记
第二季开始延续神盾局与九头蛇的斗争，然后通过一块神秘方尖碑，逐渐切入到“异人族”，以及斯凯的身世之谜。
在梅姨的指导下，斯凯从一个黑客慢慢转型成打手，这一季她的戏份远大于寇森。最后，她找回了自己的身世，并拥有了超能力，原来她的名字叫做黛西·约翰逊，也就是漫画里的“震波女”。找到身份认同后，她让别人不要再叫她斯凯，而是叫黛西。
乔斯·韦登仍然是剧集的总导演，漫威再次展示了超强的角色塑造能力。黛西成长为一名真正的特工，寇森从不那么自信地接过局长的位置，到一统分裂成两派的地下神盾局（期间还与《复联2》大联动，洛基权杖的下落就是寇森调查出来的）。还有其他几位配角的个性、能力都能做得鲜明独特，这是整个系列都能保持高评分的关键之一。
第三季：九头蛇起源之谜
“科学组”两人再度被拆散，菲兹展开拯救西蒙斯的计划，没想到其中却关联到九头蛇的起源之谜。
原来九头蛇的起源比红骷髅更早，沃德成为新的九头蛇核心战力，他要完成九头蛇组织成立的根本目的。
最后沃德与寇森小队的新仇旧恨一起清算，九头蛇到这里算是彻底瓦解了。
第四季：恶灵骑士与AI机器人
第四季上半部分聚焦恶灵骑士，下半部分变成了AI机器人艾达的危机。神盾局在这中间再次回归到公众视线，关键道具“黑暗之书”被认为是《奇异博士》里失窃的那本书，艾达在看完书后所使用的“特效”也与电影十分相似。
这时漫威影业已经独立，电视剧的剧情基本与复联故事脱离，自己玩自己的了。好在一众角色已经塑造成型，粉丝们有理由继续关注他们的故事。
第五季：时间穿越
没有了与电影联动的“负担”，第五季编剧们彻底放飞自我。
承接第四季结束寇森小队被神秘人绑架，他们直接来到了外太空，看到了被炸成粉碎的地球。
他们来到了（一个）遥远的2091年，克里人成为了幸存人类的统治者。这回拯救人类的不再是复仇者，而是神盾局特工。
回到过去之后，不知是为了蹭热度还是帮助宣传，剧情还强行和《复联3》进行了互动。
实际上灭霸和特工们没有半毛钱关系，因为他们口中的灭霸并不一定是《复联3》里的灭霸。具体后面详细讨论。
第六季开播：寇森小队已离开MCU世界？
第五季的脑洞打得太开，导致很多关于漫威宇宙的设定都越发模糊。
第六季的《神盾局特工》已经不再和电影那边有关，第一集开始的时候，灭霸的响指事件似乎压根没发生。
第五季结局讲到寇森终于耗尽了自己的生命，梅姨陪他走完了最后的旅程。西蒙斯和黛西去寻找仍然被冰封在太空的菲兹。
一找就是一年。
按照灭霸大军进攻地球（瓦坎达）的时间线来说，第五季的结局应该是刚好在《复联3》爆发“无限战争”的时候，《蚁人2》的故事也几乎在同一时间进行。
那么梅姨和寇森享受最后的时光之时，地球就已经消失了一半人口，寇森小队也难免受到波及。
也许是为了避免响指事件的“干扰”，编剧直接把故事时间推到了一年之后，但却还是和《复联4》的设定产生了冲突。
复仇者并没有在一年时间内解决灭霸的问题，这时候的地球仍然消失一半人口，情况应该是相当混乱，光处理各种乱子都有神盾局受的了。更何况寇森的接班人才刚刚上任成为新局长，还需要时间去建立威望。
只能说，第六季筹备拍摄的时候《复联4》的剧情还在严格保密之中，就连电影的很多演员都不知道剧情，更何况是已经“分家”的电视剧部门。在不知道《复联4》剧情的情况下，编剧要想在不和电影设定冲突的情况下写新的故事，也只好把时间推后，只是他们没想到推地还不够后。
好在新的故事足以让观众暂时忘记逻辑上的不通，失去了寇森的寇森小队要面临两个全新的危机，悬念在第一集就铺设地非常出色。
两个危机分成了两条故事线，寇森小队也分成了两组人马。
西蒙斯和黛西带领一队人马去外太空寻找菲兹；迈克和YOYO并没有一起去，而是留在地球，负责神盾局的事务。
5月10日开播后，豆瓣开出9.1的高分，媲美第五季的高分开局。
寇森小队从未来回来后，菲兹仍然冰冻在宇宙当中。也就是说，在同一个时间点，曾经存在两个菲兹。美国队长的问题同样道理，他决定回到过去生活，（就算是在另一个平行宇宙）也存在两个自己。
不知道是不是受到了蝴蝶效应的影响，原先成功冰冻到2091年的菲兹，这次他的飞船被炸掉了。看到太空戏的特效就知道这一季为什么只有13集了（往年的一半），第一集的经费估计已经花得七七八八。
西蒙斯和黛西一路追寻失踪飞船的下落，她们的“和风”战机也不知道从哪里得到了类似银护飞船的“跳跃”功能，可以确定她们已经离开了太阳系。
“震波女”黛西在外太空的旅程中还创出了一番名堂，她的名号令到外星人闻风丧胆。
西蒙斯又换了个新发型，一年时间她学会了外星语言，她无疑是坚决要找到自己的丈夫菲兹，可是他们的飞船已经难以坚持，队员们折兵损将，小队只剩下4个人，疲惫不堪。
就连共患难多年的黛西也觉得应该回地球，西蒙斯如果执意坚持，团队内部将会出现内乱。
找回菲兹应该是肯定的，可能编剧觉得，不虐一下科学组，就不是《神盾局特工》了。
地球这边，陪伴完寇森的梅姨归队协助迈克，他们带领的新神盾局不用处理灭霸的麻烦，而是面临神秘穿越人物的威胁。
疑似从另一个平行宇宙穿越过来了一队人马，他们要执行某种任务。具体是什么目的，成为了前期剧情的一大悬念。
侦测到异常的神盾局不能坐视不管，面对作风凶狠的神秘团伙，没有了最强战力黛西，又没有了科学组的最强智商，迈克、梅姨、YOYO三个老角色面临着前所未有的挑战。
回到有关MCU世界设定的问题上，本来《神盾局特工》和22部MCU电影是共享世界观的，尤其是前面两季还和电影的连结如此紧密，与奈飞那边“捍卫者联盟”的情况是不一样的。
照惯例，《神盾局特工》第六季应当就是《复联4》之后的故事。
可现在剧情当灭霸的事情没有发生过，逻辑上不是说不通了吗？难道寇森压根没有复活过，这是另一个平行宇宙里的故事？
其实也能说得通。
按照罗素兄弟“穿越就会创造新时间线”的说法，在MCU世界里进行时间穿越，并不会改变原来时间线的既定轨迹，而是会创造一个平行宇宙。
也就是说，寇森一伙在穿越到未来的时候，其实是去了另一个平行宇宙，而不是还在原来的时间线。等他们回到过去，又创造了一个新的平行宇宙。
在这个新的平行宇宙，灭霸虽然也来了，但很快就被打败，所以响指根本没打着。
等于说，早在第五季，寇森小队就已经离开了原来的MCU时间线。既然《复联4》打开了平行宇宙，如此理解也未尝不可。
这样编剧就舒服多了，管你灭霸和复联怎么打个天翻地覆，反正现在与《神盾局特工》无关。
现在，他们要开始书写一个只属于自己的故事。
第六季还给了粉丝一个小小的惊喜，那就是灵魂人物寇森特工还是回来了，不只是他的精神延续，他整个人都回来了。而饰演他的克拉克·格雷格不仅是主演，还升格成为了导演。
他以意想不到，又预料之中的方式回归。当然肯定不是《惊奇队长》那样的方式。
只能说，有了平行宇宙的设定，真的可以为所欲为。
